MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xylella fastidiosa M23 chromosome

Total Repeats: 41905

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010577	TGA	2	6	23	28	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680573
2	NC_010577	CCA	2	6	82	87	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182680573
3	NC_010577	TAG	2	6	179	184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680573
4	NC_010577	AGT	2	6	243	248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680573
5	NC_010577	ACA	2	6	274	279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182680573
6	NC_010577	TAC	2	6	300	305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680573
7	NC_010577	AC	4	8	347	354	50 %	0 %	0 %	50 %	182680573
8	NC_010577	TTG	2	6	371	376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182680573
9	NC_010577	CTCG	2	8	394	401	0 %	25 %	25 %	50 %	182680573
10	NC_010577	TGC	2	6	402	407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680573
11	NC_010577	TGG	2	6	465	470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182680573
12	NC_010577	TGC	2	6	501	506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680573
13	NC_010577	TTCG	2	8	554	561	0 %	50 %	25 %	25 %	182680573
14	NC_010577	ATTG	2	8	648	655	25 %	50 %	25 %	0 %	182680573
15	NC_010577	T	6	6	667	672	0 %	100 %	0 %	0 %	182680573
16	NC_010577	AAG	2	6	692	697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182680573
17	NC_010577	ATT	2	6	742	747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680573
18	NC_010577	CGAT	2	8	830	837	25 %	25 %	25 %	25 %	182680573
19	NC_010577	CCT	2	6	838	843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182680573
20	NC_010577	A	8	8	930	937	100 %	0 %	0 %	0 %	182680573
21	NC_010577	TAG	2	6	980	985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680573
22	NC_010577	CAA	2	6	1063	1068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182680573
23	NC_010577	ATT	2	6	1106	1111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680573
24	NC_010577	CTGA	2	8	1201	1208	25 %	25 %	25 %	25 %	182680573
25	NC_010577	ACA	2	6	1255	1260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182680573
26	NC_010577	GTA	2	6	1695	1700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680574
27	NC_010577	TAA	2	6	1738	1743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182680574
28	NC_010577	GAT	2	6	1793	1798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680574
29	NC_010577	CAAAAA	2	12	1801	1812	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	182680574
30	NC_010577	GAT	2	6	1914	1919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680574
31	NC_010577	TAT	3	9	2015	2023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680574
32	NC_010577	TTA	2	6	2034	2039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680574
33	NC_010577	CAA	2	6	2076	2081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182680574
34	NC_010577	TTA	2	6	2090	2095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680574
35	NC_010577	TG	3	6	2170	2175	0 %	50 %	50 %	0 %	182680574
36	NC_010577	ATT	2	6	2214	2219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680574
37	NC_010577	TTA	2	6	2253	2258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680574
38	NC_010577	ATTG	2	8	2342	2349	25 %	50 %	25 %	0 %	182680574
39	NC_010577	GGC	2	6	2444	2449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182680574
40	NC_010577	GTG	2	6	2473	2478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182680574
41	NC_010577	AAG	3	9	2533	2541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182680574
42	NC_010577	GAA	2	6	2547	2552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182680574
43	NC_010577	ATT	2	6	2602	2607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680574
44	NC_010577	GTG	2	6	2632	2637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182680574
45	NC_010577	TTC	2	6	2669	2674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182680574
46	NC_010577	AGT	2	6	2714	2719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680574
47	NC_010577	GTT	2	6	3078	3083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182680575
48	NC_010577	TTTC	2	8	3097	3104	0 %	75 %	0 %	25 %	182680575
49	NC_010577	T	6	6	3121	3126	0 %	100 %	0 %	0 %	182680575
50	NC_010577	TAAT	2	8	3279	3286	50 %	50 %	0 %	0 %	182680575
51	NC_010577	ACGTCG	2	12	3289	3300	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	182680575
52	NC_010577	AGT	2	6	3410	3415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680575
53	NC_010577	TCA	2	6	3423	3428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680575
54	NC_010577	ACG	2	6	3445	3450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182680575
55	NC_010577	ATT	2	6	3469	3474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680575
56	NC_010577	AAC	2	6	3528	3533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182680575
57	NC_010577	AGAA	2	8	3552	3559	75 %	0 %	25 %	0 %	182680575
58	NC_010577	GA	3	6	3641	3646	50 %	0 %	50 %	0 %	182680575
59	NC_010577	AAC	2	6	3651	3656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182680575
60	NC_010577	TTTTAA	2	12	3706	3717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680575
61	NC_010577	ATGG	2	8	3720	3727	25 %	25 %	50 %	0 %	182680575
62	NC_010577	CGT	2	6	3728	3733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680575
63	NC_010577	TTGA	2	8	3746	3753	25 %	50 %	25 %	0 %	182680575
64	NC_010577	TTTA	2	8	3757	3764	25 %	75 %	0 %	0 %	182680575
65	NC_010577	T	6	6	3859	3864	0 %	100 %	0 %	0 %	182680575
66	NC_010577	CTA	2	6	3902	3907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680575
67	NC_010577	T	6	6	3923	3928	0 %	100 %	0 %	0 %	182680575
68	NC_010577	T	6	6	4078	4083	0 %	100 %	0 %	0 %	182680575
69	NC_010577	GATA	2	8	4545	4552	50 %	25 %	25 %	0 %	182680576
70	NC_010577	GCT	2	6	4657	4662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680577
71	NC_010577	GGC	2	6	4670	4675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182680577
72	NC_010577	AT	3	6	4676	4681	50 %	50 %	0 %	0 %	182680577
73	NC_010577	TAC	2	6	4701	4706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680577
74	NC_010577	CAC	2	6	4775	4780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182680577
75	NC_010577	GTCT	2	8	4867	4874	0 %	50 %	25 %	25 %	182680577
76	NC_010577	AGA	2	6	4918	4923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182680577
77	NC_010577	TGG	2	6	4966	4971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182680577
78	NC_010577	CGA	2	6	4978	4983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182680577
79	NC_010577	TGG	2	6	5002	5007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182680577
80	NC_010577	CAA	2	6	5090	5095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182680577
81	NC_010577	TAC	2	6	5158	5163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680577
82	NC_010577	TCCT	2	8	5246	5253	0 %	50 %	0 %	50 %	182680577
83	NC_010577	AGTT	2	8	5269	5276	25 %	50 %	25 %	0 %	182680577
84	NC_010577	TGAT	2	8	5277	5284	25 %	50 %	25 %	0 %	182680577
85	NC_010577	GTG	2	6	5289	5294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182680577
86	NC_010577	GGT	2	6	5324	5329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182680577
87	NC_010577	TTG	2	6	5415	5420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182680577
88	NC_010577	TGC	2	6	5425	5430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680577
89	NC_010577	TGC	2	6	5524	5529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680577
90	NC_010577	TGA	2	6	5602	5607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680577
91	NC_010577	TTC	2	6	5662	5667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182680577
92	NC_010577	GGA	2	6	5737	5742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182680577
93	NC_010577	TGC	2	6	5797	5802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680577
94	NC_010577	GCT	2	6	5816	5821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680577
95	NC_010577	TCG	2	6	5931	5936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680577
96	NC_010577	CTG	2	6	5946	5951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680577
97	NC_010577	A	6	6	5980	5985	100 %	0 %	0 %	0 %	182680577
98	NC_010577	CT	3	6	6050	6055	0 %	50 %	0 %	50 %	182680577
99	NC_010577	TCA	2	6	6144	6149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680577
100	NC_010577	T	7	7	6203	6209	0 %	100 %	0 %	0 %	182680577
101	NC_010577	ATTG	2	8	6226	6233	25 %	50 %	25 %	0 %	182680577
102	NC_010577	GCC	2	6	6259	6264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182680577
103	NC_010577	GCC	2	6	6382	6387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182680577
104	NC_010577	AT	3	6	6424	6429	50 %	50 %	0 %	0 %	182680577
105	NC_010577	CGC	2	6	6430	6435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182680577
106	NC_010577	CCT	2	6	6478	6483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182680577
107	NC_010577	TGA	2	6	6625	6630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680577
108	NC_010577	ACA	2	6	6631	6636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182680577
109	NC_010577	GCC	2	6	6641	6646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182680577
110	NC_010577	TTG	2	6	6647	6652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182680577
111	NC_010577	CAAT	2	8	6803	6810	50 %	25 %	0 %	25 %	182680577
112	NC_010577	GAA	2	6	6853	6858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182680577
113	NC_010577	TAC	2	6	6919	6924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680577
114	NC_010577	TGC	2	6	6976	6981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680577
115	NC_010577	CG	3	6	7167	7172	0 %	0 %	50 %	50 %	182680578
116	NC_010577	TCA	2	6	7235	7240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680578
117	NC_010577	CAGT	2	8	7327	7334	25 %	25 %	25 %	25 %	182680578
118	NC_010577	TGG	2	6	7376	7381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182680578
119	NC_010577	ATTG	2	8	7383	7390	25 %	50 %	25 %	0 %	182680578
120	NC_010577	GTT	3	9	7407	7415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182680578
121	NC_010577	TGA	2	6	7443	7448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680578
122	NC_010577	CAT	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680578
123	NC_010577	GC	3	6	7459	7464	0 %	0 %	50 %	50 %	182680578
124	NC_010577	T	8	8	7522	7529	0 %	100 %	0 %	0 %	182680578
125	NC_010577	GC	3	6	7612	7617	0 %	0 %	50 %	50 %	182680578
126	NC_010577	TTTG	2	8	7623	7630	0 %	75 %	25 %	0 %	182680578
127	NC_010577	TCG	2	6	7640	7645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680578
128	NC_010577	ATT	2	6	7671	7676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680578
129	NC_010577	GT	3	6	7685	7690	0 %	50 %	50 %	0 %	182680578
130	NC_010577	ATT	2	6	7804	7809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680578
131	NC_010577	TAC	2	6	7890	7895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680578
132	NC_010577	TGA	2	6	8016	8021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680579
133	NC_010577	A	6	6	8021	8026	100 %	0 %	0 %	0 %	182680579
134	NC_010577	GTG	2	6	8109	8114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182680579
135	NC_010577	GCA	3	9	8119	8127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182680579
136	NC_010577	TTG	2	6	8154	8159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182680579
137	NC_010577	CGTTG	2	10	8213	8222	0 %	40 %	40 %	20 %	182680579
138	NC_010577	GAA	2	6	8294	8299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182680579
139	NC_010577	TGCTTT	2	12	8305	8316	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	182680579
140	NC_010577	A	6	6	8362	8367	100 %	0 %	0 %	0 %	182680579
141	NC_010577	GCT	2	6	8381	8386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680579
142	NC_010577	CGT	2	6	8410	8415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680579
143	NC_010577	TCA	2	6	8422	8427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680579
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165	NC_010577	TTA	2	6	9538	9543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680580
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258	NC_010577	GGA	2	6	15152	15157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182680585
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261	NC_010577	CAAC	2	8	15238	15245	50 %	0 %	0 %	50 %	182680585
262	NC_010577	TAC	2	6	15366	15371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680585
263	NC_010577	GCGTC	2	10	15659	15668	0 %	20 %	40 %	40 %	182680585
264	NC_010577	TA	3	6	15671	15676	50 %	50 %	0 %	0 %	182680585
265	NC_010577	GGTG	2	8	15761	15768	0 %	25 %	75 %	0 %	182680585
266	NC_010577	CTC	2	6	15845	15850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182680585
267	NC_010577	CACC	2	8	16016	16023	25 %	0 %	0 %	75 %	182680585
268	NC_010577	CTT	2	6	16153	16158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182680586
269	NC_010577	CTG	2	6	16230	16235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680586
270	NC_010577	CTG	2	6	16401	16406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680586
271	NC_010577	GCT	3	9	16442	16450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680586
272	NC_010577	TGA	2	6	16510	16515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680586
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274	NC_010577	ACC	2	6	16551	16556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182680586
275	NC_010577	CTG	2	6	16560	16565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680586
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280	NC_010577	ACC	2	6	17124	17129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182680587
281	NC_010577	CTGG	2	8	17155	17162	0 %	25 %	50 %	25 %	182680587
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288	NC_010577	GGC	2	6	17461	17466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182680587
289	NC_010577	TGA	2	6	17475	17480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680587
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297	NC_010577	CTGG	2	8	17802	17809	0 %	25 %	50 %	25 %	182680587
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371	NC_010577	ACAAT	2	10	25226	25235	60 %	20 %	0 %	20 %	182680593
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381	NC_010577	ACAG	2	8	25786	25793	50 %	0 %	25 %	25 %	182680594
382	NC_010577	TAC	2	6	25816	25821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680594
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387	NC_010577	TCA	2	6	25960	25965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680594
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